Doctorat en imagerie médicale

Élastographie par résonance magnétique multifréquence pour la caractérisation de l’architecture vasculaire

Description du projet

Ce projet de doctorat vise à étudier la structure et l’organisation du réseau vasculaire dans un contexte pathologique. Notre équipe interdisciplinaire et internationale, composée de physiciens, ingénieurs biomédicaux, mathématiciens, biologistes, radiologues et pathologistes, a récemment démontré que l’organisation structurelle de la vascularisation peut être évaluée à l’aide de l’élastographie par résonance magnétique multifréquence (mMRE).

La propagation des ondes de cisaillement dans les tissus biologiques fournit des informations sur leur microstructure sous-jacente. L’élastographie par résonance magnétique (MRE) permet de mesurer in vivo la propagation de ces ondes et d’en déduire les propriétés biomécaniques des tissus. En pratique clinique, la MRE est déjà bien établie pour l’évaluation de la rigidité hépatique dans la fibrose et d’autres pathologies.

La méthode développée dans ce projet étend les applications actuelles de la MRE en comblant l’écart d’échelle entre les longueurs d’onde des ondes de cisaillement et l’espacement microvasculaire, permettant ainsi une évaluation non-invasive et macroscopique de l’architecture vasculaire. Ce travail présente un intérêt clinique immédiat, de nombreuses maladies étant associées à des altérations du réseau vasculaire.

Missions

Le/La doctorant(e) sera en charge des tâches suivantes :

• Développement d’une chaîne de traitement mMRE basée sur des modèles mathématiques et des approches computationnelles existants
• Analyse d’un vaste jeu de données mMRE issu d’un modèle préclinique d’AVC et validation des résultats d’imagerie à l’aide de données histopathologiques existantes
• Transposition de la méthode à l’imagerie humaine, incluant l’optimisation des séquences, l’adaptation de la chaîne de traitement et la réalisation d’une étude pilote de preuve de concept chez des volontaires sains
• Comparaison des résultats obtenus avec des valeurs de référence issues d’atlas cérébraux humains

Qui sommes-nous et ce que nous offrons

Nous sommes une équipe interdisciplinaire et internationale collaborant étroitement depuis plus de 15 ans sur des projets liés à la MRE.

Le Pr Dr Ralph Sinkus est physicien IRM et expert reconnu dans le domaine de la MRE. Son laboratoire à Paris (CRI, U1149, INSERM) dispose d’une longue expérience en imagerie mécanique in vivo et in vitro.

La Dr Katharina Schregel est radiologue spécialisée en neuroradiologie et cheffe adjointe de section dans l‘hôpital universitaire Jena. Elle est clinicienne-chercheuse, experte en MRE préclinique et clinique appliquée aux pathologies cérébrales.

Les deux équipes offrent un accès à des plateformes IRM de pointe et à une excellente infrastructure scientifique.

Nous proposons:

• Un programme doctoral structuré avec réunions régulières, rapports d’avancement et encadrement externe, en plus d’une co-direction par le Pr Dr Sinkus et la Dr Schregel
• Un environnement de recherche interdisciplinaire et international
• Un projet innovant et translationnel à forte pertinence clinique
• Une rémunération conforme au barème doctoral de l’INSERM, ainsi qu’une prise en charge des frais de déplacement entre Paris et Jena
• La possibilité de télétravail à temps partiel

Profil recherché

Nous recherchons un(e) candidat(e) motivé(e), prêt(e) à évoluer dans un environnement interdisciplinaire et international, avec une supervision principale à Paris (France) et Jena (Allemagne). Bien que le poste soit basé à Paris, des déplacements réguliers et un travail partiel à Jena sont requis.

Profil attendu:

• Master dans un domaine pertinent (imagerie médicale, ingénierie biomédicale, physique ou domaine connexe)
• Expérience en programmation (C++ requis, Python apprécié)
• Maîtrise de l’anglais à l’oral et à l’écrit; des notions de français et/ou d’allemand sont un plus
• Inscription obligatoire dans une école doctorale parisienne et volonté de réaliser le doctorat en France; affiliation supplémentaire avec le centre hospitalier universitaire en tant que chercheur·e invité·e
• Une expérience en IRM et en analyse d’images médicales est un atout; la motivation et l’envie d’apprendre sont essentielles

Version courte

Doctorat en imagerie médicale – mMRE et architecture vasculaire

Nous proposons un poste de doctorant(e) destiné à des diplômé(e)s de Master souhaitant se spécialiser en imagerie médicale et en IRM. Le projet porte sur la caractérisation de l’architecture vasculaire à l’aide de l’élastographie par résonance magnétique multifréquence (mMRE), une méthode innovante à fort impact clinique.

Le doctorat sera réalisé en collaboration entre l’INSERM (Paris) et Jena (Allemagne), avec accès à des plateformes IRM de pointe et un encadrement international.

Profil: Master dans un domaine pertinent, compétences en C++, anglais courant, inscription dans une école doctorale parisienne.

Conditions: Rémunération selon le barème doctoral INSERM, soutien aux déplacements, télétravail partiel possible.