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RemyNicolle

Génomique translationnelle de l'hétérogénéité des néoplasies pancréatiques (GeNeHetX)

Équipe Nicolle

Département Hépato‐gastroentérologie

 

Responsable(s)

 

Composition de l'équipe

Responsable

Chercheur ou Enseignant-Chercheur statutaire

ITA : Ingénieur - Technicien

Post-doctorant

 

Présentation

GeNeHetX est une équipe ATIP-AVENIR (promotion 2022) ayant pour objectif de caractériser l’hétérogénéité inter et intra patient des tumeurs pancréatiques. Les travaux de l’équipe se focalisent sur deux axes principaux. Le premier vise à décrire l’hétérogénéité histologique et moléculaire à l’œuvre dans les adénocarcinomes pancréatiques. Ces tumeurs particulièrement fibreuses et très agressives forment un tissu à l’architecture complexe. L’utilisation d’outils issus des développements récents dans le domaine de l’intelligence artificielle combiné à des méthodes de profilage moléculaires spatialisé permet aujourd’hui de comprendre l’organisation de ces tissus complexes et de décrypter le rôle de chaque type cellulaire. Ce premier axe de modélisation de l’hétérogénéité morpho-moléculaire est fondamental pour l’autre objectif de l’équipe qui est de développer des outils cliniques, et en particulier des signatures moléculaires, pour l’aide à la décision clinique. Cet aspect translationnel de la recherche vise à transférer des outils de description phénotypique (signatures ARN théranostique notamment) pour la médecine personnalisée.

 

Publications marquantes

  • Date de publication : 05 janvier 2022 En savoir +

    PACpAInt: a deep learning approach to identify molecular subtypes of pancreatic adenocarcinoma on histology slides
    BioRXiv

    Auteurs : C. Saillard F. Delecourt B. Schmauch O. Moindrot M. Svrcek A. Bardier-Dupas J-F. Emile M. Ayadi V. Rebours L. de Mestier P. Hammel C. Neuzillet J-B. Bachet J. Iovanna N. Dusetti Y. Blum M. Richard Y. Kermezli Paradis Valérie M. Zaslavskiy P. Courtiol A. Kamoun Nicolle Rémy Cros Jérome

  • Date de publication : 18 mars 2021 En savoir +

    Tumour and stroma RNA signatures predict more accurately distant recurrence than clinicopathological factors in resected pancreatic adenocarcinoma
    Eur J Cancer .

    Auteurs : Hilmi Marc Cros Jérome Francesco Puleo Jeremy Augustin Jean-Francois Emile Magali Svrcek Hammel Pascal Tatjana Arsenijevic Jean-Luc Van Laethem Jean-Baptiste Bachet Nicolle Rémy

  • Date de publication : 11 novembre 2020 En savoir +

    A transcriptomic signature to predict adjuvant gemcitabine sensitivity in pancreatic adenocarcinoma
    Annals of Oncology.

    Auteurs : Nicolle Rémy O. Gayet P. Duconseil C. Vanbrugghe J. Roques M. Bigonnet Y. Blum N. Elarouci L. Armenoult M. Ayadi A. de Reyniès F. Puleo J. Augustin J.F. Emile M. Svrcek T. Arsenijevic P. Hammel M. Giovannini P. Grandval L. Dahan V. Moutardier M. Gilabert J.L. Van Laethem J.B. Bachet Cros Jérome J. Iovanna N.J. Dusetti

  • Date de publication : 03 juillet 2020 En savoir +

    Establishment of a pancreatic adenocarcinoma molecular gradient (PAMG) that predicts the clinical outcome of pancreatic cancer
    EBioMedicine.

    Auteurs : Nicolle Rémy Yuna Blum Pauline Duconseil Charles Vanbrugghe Nicolas Brandone Flora Poizat Julie Roques Martin Bigonnet Odile Gayet Marion Rubis Nabila Elarouci Lucile Armenoult Mira Ayadi Aurélien de Reyniès Marc Giovannini Philippe Grandval Stephane Garcia Cindy Canivet Cros Jérome Barbara Bournet Louis Buscail BACAP Consortium Vincent Moutardier Marine Gilabert Juan Iovanna Nelson Dusetti

 
 

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Les dernières publications marquantes

  • Date de publication : 06 septembre 2023 En savoir +

    Food additive emulsifiers and risk of cardiovascular disease in the NutriNet-Santé cohort: prospective cohort study
    BMJ.

    Auteurs : Laury Sellem Bernard Srour Guillaume Javaux Eloi Chazelas Benoit Chassaing Viennois Emilie Charlotte Debras Clara Salamé Nathalie Druesne-Pecollo Younes Esseddik Fabien Szabo de Edelenyi Cédric Agaësse Alexandre De Sa Rebecca Lutchia Erwan Louveau Inge Huybrechts Fabrice Pierre Xavier Coumoul Léopold K Fezeu Chantal Julia Emmanuelle Kesse-Guyot Benjamin Allès Pilar Galan Serge Hercberg Mélanie Deschasaux-Tanguy Mathilde Touvier

  • Date de publication : 13 juin 2023 En savoir +

    Pacpaint: a histology-based deep learning model uncovers the extensive intratumor molecular heterogeneity of pancreatic adenocarcinoma
    Nat Commun.

    Auteurs : Charlie Saillard Flore Delecourt Benoit Schmauch Olivier Moindrot Magali Svrcek Armelle Bardier-Dupas Jean Francois Emile Mira Ayadi Rebours Vinciane De Mestier Louis Hammel Pascal Cindy Neuzillet Jean Baptiste Bachet Juan Iovanna Nelson Dusetti Yuna Blum Magali Richard Yasmina Kermezli Paradis Valérie Mikhail Zaslavskiy Pierre Courtiol Aurelie Kamoun Nicolle Rémy Cros Jérome

  • Date de publication : 09 juin 2023 En savoir +

    Activating FcγR function depends on endosomal-signaling platforms
    iScience.

    Auteurs : Benadda Samira Nugue Mathilde Koumantou Despoina Bens Marcelle Mariacristina De Luca Olivier Pellé Monteiro Renato Evnouchidou Irini Saveanu Loredana