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RemyNicolle

Génomique translationnelle de l'hétérogénéité des néoplasies pancréatiques (GeNeHetX)

Équipe Nicolle

Département Hépato‐gastroentérologie

 

Responsable(s)

 

Composition de l'équipe

Responsable

Chercheur ou Enseignant-Chercheur statutaire

ITA : Ingénieur - Technicien

Post-doctorant

 

Présentation

GeNeHetX est une équipe ATIP-AVENIR (promotion 2022) ayant pour objectif de caractériser l’hétérogénéité inter et intra patient des tumeurs pancréatiques. Les travaux de l’équipe se focalisent sur deux axes principaux. Le premier vise à décrire l’hétérogénéité histologique et moléculaire à l’œuvre dans les adénocarcinomes pancréatiques. Ces tumeurs particulièrement fibreuses et très agressives forment un tissu à l’architecture complexe. L’utilisation d’outils issus des développements récents dans le domaine de l’intelligence artificielle combiné à des méthodes de profilage moléculaires spatialisé permet aujourd’hui de comprendre l’organisation de ces tissus complexes et de décrypter le rôle de chaque type cellulaire. Ce premier axe de modélisation de l’hétérogénéité morpho-moléculaire est fondamental pour l’autre objectif de l’équipe qui est de développer des outils cliniques, et en particulier des signatures moléculaires, pour l’aide à la décision clinique. Cet aspect translationnel de la recherche vise à transférer des outils de description phénotypique (signatures ARN théranostique notamment) pour la médecine personnalisée.

 

Publications marquantes

  • Date de publication : 05 janvier 2022 En savoir +

    PACpAInt: a deep learning approach to identify molecular subtypes of pancreatic adenocarcinoma on histology slides
    BioRXiv

    Auteurs : C. Saillard F. Delecourt B. Schmauch O. Moindrot M. Svrcek A. Bardier-Dupas J-F. Emile M. Ayadi V. Rebours L. de Mestier P. Hammel C. Neuzillet J-B. Bachet J. Iovanna N. Dusetti Y. Blum M. Richard Y. Kermezli Paradis Valérie M. Zaslavskiy P. Courtiol A. Kamoun Nicolle Rémy Cros Jérome

  • Date de publication : 18 mars 2021 En savoir +

    Tumour and stroma RNA signatures predict more accurately distant recurrence than clinicopathological factors in resected pancreatic adenocarcinoma
    Eur J Cancer .

    Auteurs : Hilmi Marc Cros Jérome Francesco Puleo Jeremy Augustin Jean-Francois Emile Magali Svrcek Hammel Pascal Tatjana Arsenijevic Jean-Luc Van Laethem Jean-Baptiste Bachet Nicolle Rémy

  • Date de publication : 11 novembre 2020 En savoir +

    A transcriptomic signature to predict adjuvant gemcitabine sensitivity in pancreatic adenocarcinoma
    Annals of Oncology.

    Auteurs : Nicolle Rémy O. Gayet P. Duconseil C. Vanbrugghe J. Roques M. Bigonnet Y. Blum N. Elarouci L. Armenoult M. Ayadi A. de Reyniès F. Puleo J. Augustin J.F. Emile M. Svrcek T. Arsenijevic P. Hammel M. Giovannini P. Grandval L. Dahan V. Moutardier M. Gilabert J.L. Van Laethem J.B. Bachet Cros Jérome J. Iovanna N.J. Dusetti

  • Date de publication : 03 juillet 2020 En savoir +

    Establishment of a pancreatic adenocarcinoma molecular gradient (PAMG) that predicts the clinical outcome of pancreatic cancer
    EBioMedicine.

    Auteurs : Nicolle Rémy Yuna Blum Pauline Duconseil Charles Vanbrugghe Nicolas Brandone Flora Poizat Julie Roques Martin Bigonnet Odile Gayet Marion Rubis Nabila Elarouci Lucile Armenoult Mira Ayadi Aurélien de Reyniès Marc Giovannini Philippe Grandval Stephane Garcia Cindy Canivet Cros Jérome Barbara Bournet Louis Buscail BACAP Consortium Vincent Moutardier Marine Gilabert Juan Iovanna Nelson Dusetti

 
 

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Les dernières publications marquantes

  • Date de publication : 17 janvier 2023 En savoir +

    ROCK2 interacts with p22phox to phosphorylate p47phox and to control NADPH oxidase activation in human monocytes
    PNAS

    Auteurs : Asma Tlili Pintard Coralie Hurtado-Nedelec Maria Margarita Liu Dan Viviana Marzaioli Thieblemont Nathalie Dang Pham My-Chan El Benna Jamel

  • Date de publication : 30 novembre 2022 En savoir +

    Comparative Analysis of a Locally Resampling MR Elastography Reconstruction Algorithm in Liver Fibrosis
    JMRI

    Auteurs : Page Gwenael Julea Felicia Paradis Valérie Vilgrain Valérie Valla Dominique Van Beers Bernard Garteiser Philippe

  • Date de publication : 03 novembre 2022 En savoir +

    JAK2V617F mutation drives vascular resident macrophages toward a pathogenic phenotype and promotes dissecting aortic aneurysm
    Nature Communications.

    Auteurs : Rida Al-Rifai Marie Vandestienne Jean-Rémi Lavillegrand Tristan Mirault Julie Cornebise Poisson Johanne Ludivine Laurans Bruno Esposito Chloé James Olivier Mansier Pierre Hirsch Fabrizia Favale Rayan Braik Camille Knosp Jose Vilar Giuseppe Rizzo Alma Zernecke Antoine-Emmanuel Saliba Alain Tedgui Maxime Lacroix Lionel Arrive Ziad Mallat Soraya Taleb Marc Diedisheim Clément Cochain Rautou Pierre-Emmanuel Hafid Ait-Oufella