Génomique translationnelle de l'hétérogénéité des néoplasies pancréatiques (GeNeHetX)
Équipe Nicolle
Département Hépato‐gastroentérologie
Composition de l'équipe
Responsable
Chercheur ou Enseignant-Chercheur statutaire
ITA : Ingénieur - Technicien
Post-doctorant
Présentation
GeNeHetX est une équipe ATIP-AVENIR (promotion 2022) ayant pour objectif de caractériser l’hétérogénéité inter et intra patient des tumeurs pancréatiques. Les travaux de l’équipe se focalisent sur deux axes principaux. Le premier vise à décrire l’hétérogénéité histologique et moléculaire à l’œuvre dans les adénocarcinomes pancréatiques. Ces tumeurs particulièrement fibreuses et très agressives forment un tissu à l’architecture complexe. L’utilisation d’outils issus des développements récents dans le domaine de l’intelligence artificielle combiné à des méthodes de profilage moléculaires spatialisé permet aujourd’hui de comprendre l’organisation de ces tissus complexes et de décrypter le rôle de chaque type cellulaire. Ce premier axe de modélisation de l’hétérogénéité morpho-moléculaire est fondamental pour l’autre objectif de l’équipe qui est de développer des outils cliniques, et en particulier des signatures moléculaires, pour l’aide à la décision clinique. Cet aspect translationnel de la recherche vise à transférer des outils de description phénotypique (signatures ARN théranostique notamment) pour la médecine personnalisée.
Publications marquantes
-
Date de publication : 05 janvier 2022 En savoir +
PACpAInt: a deep learning approach to identify molecular subtypes of pancreatic adenocarcinoma on histology slides
BioRXiv
Auteurs : C. Saillard F. Delecourt B. Schmauch O. Moindrot M. Svrcek A. Bardier-Dupas J-F. Emile M. Ayadi V. Rebours L. de Mestier P. Hammel C. Neuzillet J-B. Bachet J. Iovanna N. Dusetti Y. Blum M. Richard Y. Kermezli Paradis Valérie M. Zaslavskiy P. Courtiol A. Kamoun Nicolle Rémy Cros Jérome
-
Date de publication : 18 mars 2021 En savoir +
Tumour and stroma RNA signatures predict more accurately distant recurrence than clinicopathological factors in resected pancreatic adenocarcinoma
Eur J Cancer .
Auteurs : Hilmi Marc Cros Jérome Francesco Puleo Jeremy Augustin Jean-Francois Emile Magali Svrcek Hammel Pascal Tatjana Arsenijevic Jean-Luc Van Laethem Jean-Baptiste Bachet Nicolle Rémy
-
Date de publication : 11 novembre 2020 En savoir +
A transcriptomic signature to predict adjuvant gemcitabine sensitivity in pancreatic adenocarcinoma
Annals of Oncology.
Auteurs : Nicolle Rémy O. Gayet P. Duconseil C. Vanbrugghe J. Roques M. Bigonnet Y. Blum N. Elarouci L. Armenoult M. Ayadi A. de Reyniès F. Puleo J. Augustin J.F. Emile M. Svrcek T. Arsenijevic P. Hammel M. Giovannini P. Grandval L. Dahan V. Moutardier M. Gilabert J.L. Van Laethem J.B. Bachet Cros Jérome J. Iovanna N.J. Dusetti
-
Date de publication : 03 juillet 2020 En savoir +
Establishment of a pancreatic adenocarcinoma molecular gradient (PAMG) that predicts the clinical outcome of pancreatic cancer
EBioMedicine.
Auteurs : Nicolle Rémy Yuna Blum Pauline Duconseil Charles Vanbrugghe Nicolas Brandone Flora Poizat Julie Roques Martin Bigonnet Odile Gayet Marion Rubis Nabila Elarouci Lucile Armenoult Mira Ayadi Aurélien de Reyniès Marc Giovannini Philippe Grandval Stephane Garcia Cindy Canivet Cros Jérome Barbara Bournet Louis Buscail BACAP Consortium Vincent Moutardier Marine Gilabert Juan Iovanna Nelson Dusetti