Le microbiote est devenu un sujet d’intérêt majeur pour beaucoup de spécialités. Dans ce contexte, le plateau 16s vous accompagne dans vos projets microbiotes, et après discussion, vous propose d’analyser vos échantillons (de l’extraction ADN aux analyses bioinformatiques).
Prestations :
- Réception des échantillons (selles, jus caecal…)
- Extraction ADN (QIAamp PowerFecalPro DNA kit, Qiacub)
- Amplification 16s rDNA (région V4 -515F 806R) et indexage
- Séquençage Illumina (MiSeq)
- Analyses bioinformatiques (outils: FROGS, phyloseq…)
et rendu des résultats: tableaux d’abondances, composition taxonomique, alpha / beta diversités, analyses discriminantes…
Pour toute question, n’hésitez pas à nous contacter.
