• Contrat : CDD
  • Équipe : Paradis / Couvineau
  • Date de début : 01 octobre 2024
  • Date de fin : 31 octobre 2024
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Détails de l'offre

Mission principale

Ce poste d’Assistant Ingénieur est à pourvoir au sein de l’équipe Paradis-Couvineau « De l’Inflammation au Cancer dans les Maladies Digestives» (INDiD) dont le but est de comprendre l’hétérogénéité des maladies inflammatoires chroniques du foie et du pancréas et leur lien avec l’apparition et la biologie du cancer. La personne recrutée sera supervisée par le Dr. Etienne Becht, un chercheur en immunologie computationnelle qui a récemment rejoint l’équipe pour y développer des axes de recherche en immunologie et bioinformatique.

La cytométrie en flux est une technique mature permettant d’obtenir des profils d’expression de protéine à un niveau unicellulaire. Elle est cependant très limitée en nombre de protéines mesurées. Nos travaux précédents ont montré que combiner des techniques d’apprentissage machine (“intelligence artificielle”) à un protocole de cytométrie en flux parallélisée permettait d’augmenter drastiquement le nombre de types cellulaires identifiés et le nombre de marqueurs de surface étudiés (de 20 initialement à plus de 300). Le but de notre projet est maintenant d’appliquer cette technique à des échantillons humains afin d’étudier en profondeur la composition et l’orientation fonctionnelle du microenvironnement immunitaire dans les maladies inflammatoires chroniques et les tumeurs.

Activités principales

La personne recrutée sera responsable

  • De participer au processing d’échantillons humains (isolation et cryopréservation des cellules d’intérêt)
  • De développer et valider des panels de cytométrie en flux (conventionnelle et bientôt spectrale) : marquage des cellules et acquisition des données
  • De réaliser des expériences de cytométrie en flux «massivement parallèle» (BioLegend LEGENDScreen et/ou BD Lyoplate)
  • Développer l’axe « cytométrie avec imagerie » (cytomètre ImageStream Anmis MKII – en collaboration avec la plateforme de cytométrie du CRI pour l’acquisition des données)
  • Participation à la gestion commune du laboratoire (gestion des stocks, commande des réactifs…)
  • Apte à collaborer avec des chercheurs bioinformaticiens, biologistes, ou médecins dans la conception et l’analyse des expériences
  • Mener des expériences de validation au besoin (Western blot, PCR …)

Spécificité(s) et environnement du poste

  • Travail avec échantillons humains
  • Le laboratoire se trouve à l’hôpital Beaujon (Clichy) mais une partie des expériences sera réalisée sur le site de la faculté de médecine de l’hôpital Bichat (Paris XVIIe)

Connaissances

  • Exposition à un ou des thèmes parmi les suivants : biologie cellulaire, immunologie, biologie du cancer

Savoir-faire

  • Bases théoriques en cytométrie en flux, une expérience pratique est un plus

Aptitudes

  • Apte à réaliser des expériences de manière indépendante après formation
  • Rigueur scientifique et curiosité
  • Capacité à communiquer les résultats observés à l’équipe de manière transparente
  • Maintien d’un cahier de laboratoire (informatique)
  • Esprit d’équipe
  • Autonomie et polyvalence
  • Français et/ou anglais professionnel

Expérience(s) souhaité(s)

0 à 5 ans d’expérience post-Master

Niveau de diplôme et formation(s)

Diplôme de Master (bac +5) ou équivalent dans un domaine des sciences de la vie.

 

Date de prise de fonction : A partir de janvier 2025

Temps de travail : Temps plein

Activités télétravaillables : Télétravail occasionnel possible, après période d’immersion et formation. 

Date limite de candidature : 31 octobre 2024

 

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Documents